SMK Muhammadiyah 9 memiliki beberapa program kegiatan yang terpusat kepada siswa.Salah satu program kegiatan Sekolah adalah pembiasaan kegiatan pagi dengan literasi pagi tadarus, sholat dhuha dan kultum ( kuliah tujuh menit ) yang di sampaikan oleh siswa dan siswi secara terjadwal.
Adapun tujuan dari program Pembiasaan membaca AlQuran dan salat dhuha ini adalah untuk menanamkan kesadaran dan meningkatkan aspek spiritual siswa.
Dengan aspek spiritual yang kuat diharapkan siswa dapat menjadi pribadi yang sholeh dan sholihah dan berakhlak karimah.
Beberapa manfaat yang didapat bagi siswa SMK Muhammadiyah 9 mengikuti kegiatan sholat dhua secara bersama-sama antara lain:
1.Siswa terbiasa melaksanakan wudhu
2. Siswa di didik tepat waktu
3. Siswa memperoleh kebaikan berupa pahala
4.Siswa memperoleh pengalaman religius
5.siswa memperoleh pengalaman dan terbiasa berbicara didepan umum.